如何正确获取离体根系图像

2022-06-23 14:48:04 点将科技 16

分析原理

       通过扫描仪将离体洗好的根系扫描获取图像,使用专业根系分析软件对根系图像分析,得到根系长度、平均直径、表面积、体积、根尖数等根系表型数据。分析的直接对象是图片,所以获取高质量的根系图片获得准确数据的基础。

         适用于DJ-GX02根系分析仪。

适用对象:

离体洗根后的植物根系

图像获取设备:

        仪器标配含有经过严格校准的扫描仪以保证图像的质量。每台扫描仪配有专用控制软件,用于参数设置和图像获取、保存。

       如果使用普通扫描仪,只有扫描头部位的光源,也就是下方照光,因为根系的立体结构,根系在背景板上会留下阴影,扫描出来的图像上,根系附近就有阴影,图像不够清晰,影响分析。


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       双光源投射扫描,上方照光,下方扫描成像,得到根系的投影。由于光源来自于上方,没有根系的地方将是白色的背景,有根系的地方光受根系遮挡,根系呈现黑色,四周边界清晰,根与背景区分非常明显,对分析非常有利。

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扫根成像:

      使用投射扫描时,需要将上光源的背景板取下,否则背景板将上光源遮挡,扫描的图像将一团黑。

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        放置定位框,按照如图所示的方向,注意定位框凹陷一端(箭头所指)的位置。为了放置根盘直接压在上光源玻璃板上,随货配有增高垫,如左下图所示,放置在面板上。

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洗好的根系放置在根盘内,随货配有3种不同尺寸的根盘,选择适合根系大小的,放入根系和清水,细小的根系在水中会分散开,便于成像。

 对于根系基部比较大的根系,比如树苗、玉米的根,可将根系分别剪下来,平铺到根盘中;

 如果一个根系上根的数量很大,可以分多次扫描,分析时将根盘的数据累加;

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     扫描根系可以提前预览,保存只有根系的图像,抛弃根盘的区域,便于后面软件直接自动分析。

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扫描参数的设置:

        扫描参数决定了扫描图像的质量,参数中最为关键的是分辨率,一般设置300ppi即可,满足绝大多数样品的成像需求;如果样品非常细小,可以选择更高的分辨率值,比如600ppi;设置是在成像控制软件界面。更高的分辨率意味着图像占的内存更大。

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    图像扫描完成后,要保存到计算机硬盘中,选择jpg、tiff均可。建议先将所有根系的图像全部扫描完成后再进行图像分析,软件有批处理分析功能。

3副根系扫描图

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